Regulons: Difference between revisions
Appearance
No edit summary |
|||
| Line 1: | Line 1: | ||
Overview on the regulons in ''B. subtilis'' | Overview on the regulons in ''B. subtilis'' | ||
= [[Sigma factors]] = | |||
* [[SigB regulon]] | |||
* [[SigD regulon]] | |||
* [[SigE regulon]] | |||
* [[SigF regulon]] | |||
* [[SigG regulon]] | |||
* [[SigH regulon]] | |||
* [[SigI regulon]] | |||
* [[SigK regulon]] | |||
* [[SigL regulon]] | |||
* [[SigM regulon]] | |||
* [[SigW regulon]] | |||
* [[SigX regulon]] | |||
* [[SigY regulon]] | |||
* [[Xpf regulon]] | |||
* [[YlaC regulon]] | |||
* [[YvrI-YvrHa regulon]] | |||
= DNA-binding regulators = | |||
* [[Abh regulon]] | |||
* [[AbrB regulon]] | |||
* [[AcoR regulon]] | |||
* [[AdaA regulon]] | |||
* [[AdhR regulon]] | |||
* [[AhrC regulon]] | |||
* [[AlsR regulon]] | |||
* [[AnsR regulon]] | |||
* [[AraR regulon]] | |||
* [[ArsR regulon]] | |||
* [[AseR regulon]] | |||
* [[AzlB regulon]] | |||
* [[BceR regulon]] | |||
* [[BirA regulon]] | |||
* [[BkdR regulon]] | |||
* [[BltR regulon]] | |||
* [[BmrR regulon]] | |||
* [[BsdA regulon]] | |||
* [[Btr regulon]] | |||
* [[CatR regulon]] | |||
* [[CcpA regulon]] | |||
* [[CcpC regulon]] | |||
* [[CcpN regulon]] | |||
* [[CggR regulon]] | |||
* [[CitR regulon]] | |||
* [[CitT regulon]] | |||
* [[CodY regulon]] | |||
* [[ComA regulon]] | |||
* [[ComK regulon]] | |||
* [[Cso regulon]] | |||
* [[CsoR regulon]] | |||
* [[CssR regulon]] | |||
* [[CtsR regulon]] | |||
* [[CymR regulon]] | |||
* [[CysL regulon]] | |||
* [[CzrA regulon]] | |||
* [[DegU regulon]] | |||
* [[DeoR regulon]] | |||
* [[DesR regulon]] | |||
* [[DnaA regulon]] | |||
* [[ExuR regulon]] | |||
* [[FadR regulon]] | |||
* [[FapR regulon]] | |||
* [[FatR regulon]] | |||
* [[Fnr regulon]] | |||
* [[FruR regulon]] | |||
* [[Fur regulon]] | |||
* [[GabR regulon]] | |||
* [[GerE regulon]] | |||
* [[GerR regulon]] | |||
* [[GlnL regulon]] | |||
* [[GlnR regulon]] | |||
* [[GltC regulon]] | |||
* [[GltR regulon]] | |||
* [[GlvR regulon]] | |||
* [[GmuR regulon]] | |||
* [[GntR regulon]] | |||
* [[GutR regulon]] | |||
* [[HrcA regulon]] | |||
* [[HxlR regulon]] | |||
* [[ImmR regulon]] | |||
* [[IolR regulon]] | |||
* [[KdgR regulon]] | |||
* [[KipR regulon]] | |||
* [[LacR regulon]] | |||
* [[LevR regulon]] | |||
* [[LexA regulon]] | |||
* [[LiaR regulon]] | |||
* [[LicR regulon]] | |||
* [[LmrA regulon]] | |||
* [[LutR regulon]] | |||
* [[LytR regulon]] | |||
* [[MalR regulon]] | |||
* [[ManR regulon]] | |||
* [[MdtR regulon]] | |||
* [[MhqR regulon]] | |||
* [[MntR regulon]] | |||
* [[Mta regulon]] | |||
* [[MsmR regulon]] | |||
* [[MtlR regulon]] | |||
* [[NadR regulon]] | |||
* [[NatR regulon]] | |||
* [[NsrR regulon]] | |||
* [[NtdR regulon]] | |||
* [[OhrR regulon]] | |||
* [[PadR regulon]] | |||
* [[PerR regulon]] | |||
* [[PhoP regulon]] | |||
* [[PucR regulon]] | |||
* [[PurR regulon]] | |||
* [[ResD regulon]] | |||
* [[Rex regulon]] | |||
* [[RghR regulon]] | |||
* [[RocR regulon]] | |||
* [[Rok regulon]] | |||
* [[RsfA regulon]] | |||
* [[SalA regulon]] | |||
* [[ScoC regulon]] | |||
* [[SdpR regulon]] | |||
* [[SenS regulon]] | |||
* [[SinR regulon]] | |||
* [[SlrR regulon]] | |||
* [[Spo0A regulon]] | |||
* [[SpoIIID regulon]] | |||
* [[Spx regulon]] | |||
* [[TnrA regulon]] | |||
* [[TreR regulon]] | |||
* [[WalR regulon]] | |||
* [[Xre regulon]] | |||
* [[XylR regulon]] | |||
* [[YcbG regulon]] | |||
* [[YclJ regulon]] | |||
* [[YcnK regulon]] | |||
* [[YdfI regulon]] | |||
* [[YesS regulon]] | |||
* [[YetL regulon]] | |||
* [[YfhP regulon]] | |||
* [[YfmP regulon]] | |||
* [[YkrP regulon]] | |||
* [[YodB regulon]] | |||
* [[YofA regulon]] | |||
* [[YrkP regulon]] | |||
* [[YtlI regulon]] | |||
* [[YtrA regulon]] | |||
* [[YvoA regulon]] | |||
* [[YvrHb regulon]] | |||
* [[YwcC regulon]] | |||
* [[YxaF regulon]] | |||
* [[YxdJ regulon]] | |||
* [[Zur regulon]] | |||
= [[RNA switch|RNA switches]] = | |||
* [[A-box]] | |||
* [[EAR riboswitch]] | |||
* [[FMN-box]] | |||
* [[G-box]] | |||
* [[GlcT riboswitch]] | |||
* [[glmS ribozyme]] | |||
* [[GlpP riboswitch]] | |||
* [[HutP riboswitch]] | |||
* [[L-box]] | |||
* [[LicT riboswitch]] | |||
* [[M-box]] | |||
* [[preQ1 riboswitch]] | |||
* [[PyrR riboswitch]] | |||
* [[RplT riboswitch]] | |||
* [[SacT riboswitch]] | |||
* [[SacY riboswitch]] | |||
* [[S-box]] | |||
* [[T-box]] | |||
* [[Thi-box]] | |||
* [[TRAP riboswitch]] | |||
* [[YdaO riboswitch]] | |||
* [[RNA switch/ other]] | |||
= Additional regulatory mechanisms = | |||
* [[CitB regulon]] | |||
* [[ComN regulon]] | |||
* [[CsrA regulon]] | |||
* [[FsrA regulon]] | |||
* [[MifM regulon]] | |||
* [[ratA regulon]] | |||
* [[SR1 regulon]] | |||
* [[Stringent response]] | |||
Revision as of 16:04, 7 December 2010
Overview on the regulons in B. subtilis
Sigma factors
- SigB regulon
- SigD regulon
- SigE regulon
- SigF regulon
- SigG regulon
- SigH regulon
- SigI regulon
- SigK regulon
- SigL regulon
- SigM regulon
- SigW regulon
- SigX regulon
- SigY regulon
- Xpf regulon
- YlaC regulon
- YvrI-YvrHa regulon
DNA-binding regulators
- Abh regulon
- AbrB regulon
- AcoR regulon
- AdaA regulon
- AdhR regulon
- AhrC regulon
- AlsR regulon
- AnsR regulon
- AraR regulon
- ArsR regulon
- AseR regulon
- AzlB regulon
- BceR regulon
- BirA regulon
- BkdR regulon
- BltR regulon
- BmrR regulon
- BsdA regulon
- Btr regulon
- CatR regulon
- CcpA regulon
- CcpC regulon
- CcpN regulon
- CggR regulon
- CitR regulon
- CitT regulon
- CodY regulon
- ComA regulon
- ComK regulon
- Cso regulon
- CsoR regulon
- CssR regulon
- CtsR regulon
- CymR regulon
- CysL regulon
- CzrA regulon
- DegU regulon
- DeoR regulon
- DesR regulon
- DnaA regulon
- ExuR regulon
- FadR regulon
- FapR regulon
- FatR regulon
- Fnr regulon
- FruR regulon
- Fur regulon
- GabR regulon
- GerE regulon
- GerR regulon
- GlnL regulon
- GlnR regulon
- GltC regulon
- GltR regulon
- GlvR regulon
- GmuR regulon
- GntR regulon
- GutR regulon
- HrcA regulon
- HxlR regulon
- ImmR regulon
- IolR regulon
- KdgR regulon
- KipR regulon
- LacR regulon
- LevR regulon
- LexA regulon
- LiaR regulon
- LicR regulon
- LmrA regulon
- LutR regulon
- LytR regulon
- MalR regulon
- ManR regulon
- MdtR regulon
- MhqR regulon
- MntR regulon
- Mta regulon
- MsmR regulon
- MtlR regulon
- NadR regulon
- NatR regulon
- NsrR regulon
- NtdR regulon
- OhrR regulon
- PadR regulon
- PerR regulon
- PhoP regulon
- PucR regulon
- PurR regulon
- ResD regulon
- Rex regulon
- RghR regulon
- RocR regulon
- Rok regulon
- RsfA regulon
- SalA regulon
- ScoC regulon
- SdpR regulon
- SenS regulon
- SinR regulon
- SlrR regulon
- Spo0A regulon
- SpoIIID regulon
- Spx regulon
- TnrA regulon
- TreR regulon
- WalR regulon
- Xre regulon
- XylR regulon
- YcbG regulon
- YclJ regulon
- YcnK regulon
- YdfI regulon
- YesS regulon
- YetL regulon
- YfhP regulon
- YfmP regulon
- YkrP regulon
- YodB regulon
- YofA regulon
- YrkP regulon
- YtlI regulon
- YtrA regulon
- YvoA regulon
- YvrHb regulon
- YwcC regulon
- YxaF regulon
- YxdJ regulon
- Zur regulon
RNA switches
- A-box
- EAR riboswitch
- FMN-box
- G-box
- GlcT riboswitch
- glmS ribozyme
- GlpP riboswitch
- HutP riboswitch
- L-box
- LicT riboswitch
- M-box
- preQ1 riboswitch
- PyrR riboswitch
- RplT riboswitch
- SacT riboswitch
- SacY riboswitch
- S-box
- T-box
- Thi-box
- TRAP riboswitch
- YdaO riboswitch
- RNA switch/ other