Difference between revisions of "SunA"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
Line 1: Line 1:
* '''Description:''' sublancin 168 lantibiotic antimicrobial precursor peptide <br/><br/>
+
1804 http://bpamykir.posterous.com/nokia-n71 ������� ���� ��� nokia n71 http://ccaueat.posterous.com/windos-nokia-5300 ������� ���������� ���� windos ������� �� nokia 5300 http://npcnbyguo.posterous.com/123562443 ������� ���������� ���� ����� ������ �� ������� http://xgxmcmhzaa.posterous.com/txt ������� ��������� ��� �������� ��� ������ ���� txt http://mksaqqqavw.posterous.com/nokia-6300-65730 ������� ���� ���� ����� �� nokia 6300 http://kkcitaqgi.posterous.com/simens ������� �������� simens ��������� http://pjiedtjx.posterous.com/123500004 ������� ������������� ������� ��������� ����� http://peogoux.posterous.com/nokia-n82 ���� ���� ��� nokia n82 ������� http://hecydurw.posterous.com/nokia-n72 ������� �������������� ��� ��� nokia n72 http://bmgioiqje.posterous.com/320 ������� ���� ����� �� ������� ���� ������� 320 http://ryyiniyhnm.posterous.com/nokia-63-00 ������� ���������� ���� � ��������� �� ������� �� nokia 63 00 http://qnfmziuoke.posterous.com/mix ������� ��� mix ���� ��� ���������� �������� http://ihbfnnjoq.posterous.com/nokia-51524 ������� ���������� ������������� ���� ��� nokia http://uvaschu.posterous.com/nokia-28013 ������� ���� ��� �������� �������� nokia http://hyufowc.posterous.com/123535441 ������� ���� �� ������� �������� http://yjathagk.posterous.com/java-motorola-e398 ������� ��������� ��� ��������� java ���� �� �������� motorola e398 http://hecydurw.posterous.com/nokia-n-73-me ������� ������� ���� ��� nokia n 73 me http://txrhrv.posterous.com/nokia-240320 ������� ���������� ���������� ���� ��� nokia ������� 240*320 http://ycwtnmcvu.posterous.com/nokia-n73-23559 �������  ��������� ������ �� nokia n73 � ���� http://fcktry.posterous.com/sony-ericsson-k750i ��� ��������� ��� �������� sony ericsson k750i ������� http://vwkbccgtxv.posterous.com/nokia-n76 ���������� ���� ��� nokia n76 ������� http://axvmxspik.posterous.com/java-22896 java ������������� �� �������- ������� http://wtxsbb.posterous.com/nokia-6500 ������� ����� ���� �� ������� nokia 6500 http://gyzqeovax.posterous.com/123486871 ��� ����� ����� ����������� �������  ���� �� ��� �������� http://bzasfgdo.posterous.com/nokia-6110 ������� nokia 6110 ������������ ������� http://odwhhocpgq.posterous.com/123549261 ������� ���������� �� ������� ���� http://mksaqqqavw.posterous.com/nokia-n73-11695 ������� ���� ����� ����� ��� nokia n73 http://kxnmhbnmi.posterous.com/nokia-e50 ������� ���������� ���� �� nokia e50 http://rgffjftnz.posterous.com/123606325 ���� �� ������� �� �����  ������� http://htqyjcmc.posterous.com/aa-nokia-n ������� ��a�a�� ���� ��� nokia n ����� http://gyzqeovax.posterous.com/123487233 ������� ��������� ��� ������ ���������� ���������� �� �������� http://qytgbih.posterous.com/-samsung-l700 ������� ��������� + ��� �������� samsung l700 http://qerhqeaz.posterous.com/6233-gangstar-cry-citi-2 ������� ���������� ���� �� ������� 6233 gangstar cry citi 2 http://bmgioiqje.posterous.com/123527451 �������  ��������� ��� �������� ����� ����� �� ������� �������������� http://pjakmaitgw.posterous.com/1-2-nokia6233 ������� ����� 1, 2 ����� ������ �� ������� nokia6233 http://jgtnaiax.posterous.com/123644670 ������� ��������� � ����  �� ��� �������� ����� http://gyzqeovax.posterous.com/doom ������� ���� doom ��� �������� �������� http://arminra.posterous.com/nokia-3250-52716 ������� nokia 3250 ����������� ���� ����� ������� http://bwvgek.posterous.com/nokia-6120c ������� ���� � ���� ��� nokia 6120c http://ktuvqz.posterous.com/sony-ericsson ������� ��������� ���� ��� �� �������� sony ericsson http://xgxmcmhzaa.posterous.com/nokia-n73-26470 ������� ���������� ���� ��� nokia n73 ������� ������ http://jibtbdabk.posterous.com/nokia-6260 ������� ���� �� nokia 6260 http://htqyjcmc.posterous.com/123533253 ������� ��������� ��� ���. �������� ����� ���� http://whthioxi.posterous.com/benq-siemens-ef81 ������� ���� �� ������� benq-siemens ef81 http://hdwbefdurm.posterous.com/se-k750i ������� ����� ����� ��������� ������� ������� se k750i http://wtxsbb.posterous.com/123450500 �������  ��������� ����� �� ������� http://aohuvrnxku.posterous.com/123484298 ������� ������ ���� �� ������� http://ryyiniyhnm.posterous.com/sony-ericsson-k-550i ������� ���� �� ������� �� sony ericsson k 550i http://tjotazccm.posterous.com/nokia-3250-69303 ������� ���� ��� nokia 3250 http://synrggwkhp.posterous.com/gt-s5230 �� ������� gt s5230 ���� �������
 
 
{| align="right" border="1" cellpadding="2"
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Gene name'''
 
|''sunA''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Synonyms''' || ''yolG ''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Essential''' || no
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Product''' || sublancin 168 lantibiotic antimicrobial precursor peptide
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Function''' || antimicrobial peptide
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''MW, pI''' || 5 kDa, 7.963 
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Gene length, protein length''' || 168 bp, 56 aa
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Immediate neighbours''' || ''[[sunT]]'', ''[[sunI]]''
 
|-
 
|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"|'''Get the DNA and protein [http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-e+&#91;EMBLCDS:CAB14066&#93;+-newId sequences] <br/> (Barbe ''et al.'', 2009)'''
 
|-
 
|colspan="2" | '''Genetic context''' <br/> [[Image:sunA_context.gif]]
 
<div align="right"> <small>This image was kindly provided by [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/ SubtiList]</small></div>
 
|-
 
|}
 
 
 
__TOC__
 
 
 
<br/><br/>
 
 
 
= [[Categories]] containing this gene/protein =
 
{{SubtiWiki category|[[miscellaneous metabolic pathways]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[biosynthesis of antibacterial compounds]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[SP-beta prophage]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[membrane proteins]]}}
 
 
 
= This gene is a member of the following [[regulons]] =
 
{{SubtiWiki regulon|[[Abh regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[AbrB regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[Rok regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[YvrHb regulon]]}}
 
 
 
=The gene=
 
 
 
=== Basic information ===
 
 
 
* '''Locus tag:''' BSU21480
 
 
 
===Phenotypes of a mutant ===
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''DBTBS entry:''' [http://dbtbs.hgc.jp/COG/prom/sunA.html]
 
 
 
* '''SubtiList entry:''' [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/genome.cgi?gene_detail+BG12682]
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
 
 
 
 
 
 
=The protein=
 
 
 
=== Basic information/ Evolution ===
 
 
 
* '''Catalyzed reaction/ biological activity:'''
 
 
 
* '''Protein family:''' IPP isomerase type 2 family (according to Swiss-Prot)
 
 
 
* '''Paralogous protein(s):'''
 
 
 
=== Extended information on the protein ===
 
 
 
* '''Kinetic information:'''
 
 
 
* '''Domains:'''
 
 
 
* '''Modification:''' contains a glucose attached to a cysteine residue, glycosylation is essential for its antimicrobial activity {{PubMed|21196935}}
 
 
 
* '''Cofactor(s):'''
 
 
 
* '''Effectors of protein activity:'''
 
 
 
* '''[[SubtInteract|Interactions]]:'''
 
 
 
* '''[[Localization]]:''' cell membrane (according to Swiss-Prot)
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''Structure:'''
 
 
 
* '''UniProt:''' [http://www.uniprot.org/uniprot/P68577 P68577]
 
 
 
* '''KEGG entry:''' [http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?bsu:BSU21480]
 
 
 
* '''E.C. number:'''
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
=Expression and regulation=
 
 
 
* '''Operon:''' ''sunA'' {{PubMed|16306698}}
 
 
 
* '''Expression browser:''' [http://genome.jouy.inra.fr/cgi-bin/seb/viewdetail.py?id=sunA_2269521_2269691_-1 sunA] {{PubMed|22383849}}
 
 
 
* '''Sigma factor:'''
 
 
 
* '''Regulation:'''
 
** repressed by [[Rok]] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
** repressed during logrithmic growth ([[AbrB]]) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/17720793 PubMed]
 
 
 
* '''Regulatory mechanism:'''
 
** activated by [[YvrHb]] {{PubMed|16306698}}
 
** [[Rok]]: transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
** [[AbrB]]: transcription repression{{PubMed|20817675,17720793}}
 
** [[Abh]]: transcription activation {{PubMed|20817675,19465659}}
 
 
 
* '''Additional information:''' the mRNA is very stable (half-life > 15 min) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/12884008 PubMed]
 
 
 
=Biological materials =
 
 
 
* '''Mutant:'''
 
 
 
* '''Expression vector:'''
 
       
 
* '''lacZ fusion:'''
 
 
 
* '''GFP fusion:'''
 
 
 
* '''two-hybrid system:'''
 
 
 
* '''Antibody:'''
 
 
 
=Labs working on this gene/protein=
 
 
 
=Your additional remarks=
 
 
 
=References=
 
'''Additional publications:''' {{PubMed|20817675,21196935,21910430}}
 
<pubmed>12884008,9722542 15743949,17720793,16306698, 19465659 21196935</pubmed>
 
 
 
[[Category:Protein-coding genes]]
 

Revision as of 19:27, 18 April 2012

1804 http://bpamykir.posterous.com/nokia-n71 ������� ���� ��� nokia n71 http://ccaueat.posterous.com/windos-nokia-5300 ������� ���������� ���� windos ������� �� nokia 5300 http://npcnbyguo.posterous.com/123562443 ������� ���������� ���� ����� ������ �� ������� http://xgxmcmhzaa.posterous.com/txt ������� ��������� ��� �������� ��� ������ ���� txt http://mksaqqqavw.posterous.com/nokia-6300-65730 ������� ���� ���� ����� �� nokia 6300 http://kkcitaqgi.posterous.com/simens ������� �������� simens ��������� http://pjiedtjx.posterous.com/123500004 ������� ������������� ������� ��������� ����� http://peogoux.posterous.com/nokia-n82 ���� ���� ��� nokia n82 ������� http://hecydurw.posterous.com/nokia-n72 ������� �������������� ��� ��� nokia n72 http://bmgioiqje.posterous.com/320 ������� ���� ����� �� ������� ���� ������� 320 http://ryyiniyhnm.posterous.com/nokia-63-00 ������� ���������� ���� � ��������� �� ������� �� nokia 63 00 http://qnfmziuoke.posterous.com/mix ������� ��� mix ���� ��� ���������� �������� http://ihbfnnjoq.posterous.com/nokia-51524 ������� ���������� ������������� ���� ��� nokia http://uvaschu.posterous.com/nokia-28013 ������� ���� ��� �������� �������� nokia http://hyufowc.posterous.com/123535441 ������� ���� �� ������� �������� http://yjathagk.posterous.com/java-motorola-e398 ������� ��������� ��� ��������� java ���� �� �������� motorola e398 http://hecydurw.posterous.com/nokia-n-73-me ������� ������� ���� ��� nokia n 73 me http://txrhrv.posterous.com/nokia-240320 ������� ���������� ���������� ���� ��� nokia ������� 240*320 http://ycwtnmcvu.posterous.com/nokia-n73-23559 ������� ��������� ������ �� nokia n73 � ���� http://fcktry.posterous.com/sony-ericsson-k750i ��� ��������� ��� �������� sony ericsson k750i ������� http://vwkbccgtxv.posterous.com/nokia-n76 ���������� ���� ��� nokia n76 ������� http://axvmxspik.posterous.com/java-22896 java ������������� �� �������- ������� http://wtxsbb.posterous.com/nokia-6500 ������� ����� ���� �� ������� nokia 6500 http://gyzqeovax.posterous.com/123486871 ��� ����� ����� ����������� ������� ���� �� ��� �������� http://bzasfgdo.posterous.com/nokia-6110 ������� nokia 6110 ������������ ������� http://odwhhocpgq.posterous.com/123549261 ������� ���������� �� ������� ���� http://mksaqqqavw.posterous.com/nokia-n73-11695 ������� ���� ����� ����� ��� nokia n73 http://kxnmhbnmi.posterous.com/nokia-e50 ������� ���������� ���� �� nokia e50 http://rgffjftnz.posterous.com/123606325 ���� �� ������� �� ����� ������� http://htqyjcmc.posterous.com/aa-nokia-n ������� ��a�a�� ���� ��� nokia n ����� http://gyzqeovax.posterous.com/123487233 ������� ��������� ��� ������ ���������� ���������� �� �������� http://qytgbih.posterous.com/-samsung-l700 ������� ��������� + ��� �������� samsung l700 http://qerhqeaz.posterous.com/6233-gangstar-cry-citi-2 ������� ���������� ���� �� ������� 6233 gangstar cry citi 2 http://bmgioiqje.posterous.com/123527451 ������� ��������� ��� �������� ����� ����� �� ������� �������������� http://pjakmaitgw.posterous.com/1-2-nokia6233 ������� ����� 1, 2 ����� ������ �� ������� nokia6233 http://jgtnaiax.posterous.com/123644670 ������� ��������� � ���� �� ��� �������� ����� http://gyzqeovax.posterous.com/doom ������� ���� doom ��� �������� �������� http://arminra.posterous.com/nokia-3250-52716 ������� nokia 3250 ����������� ���� ����� ������� http://bwvgek.posterous.com/nokia-6120c ������� ���� � ���� ��� nokia 6120c http://ktuvqz.posterous.com/sony-ericsson ������� ��������� ���� ��� �� �������� sony ericsson http://xgxmcmhzaa.posterous.com/nokia-n73-26470 ������� ���������� ���� ��� nokia n73 ������� ������ http://jibtbdabk.posterous.com/nokia-6260 ������� ���� �� nokia 6260 http://htqyjcmc.posterous.com/123533253 ������� ��������� ��� ���. �������� ����� ���� http://whthioxi.posterous.com/benq-siemens-ef81 ������� ���� �� ������� benq-siemens ef81 http://hdwbefdurm.posterous.com/se-k750i ������� ����� ����� ��������� ������� ������� se k750i http://wtxsbb.posterous.com/123450500 ������� ��������� ����� �� ������� http://aohuvrnxku.posterous.com/123484298 ������� ������ ���� �� ������� http://ryyiniyhnm.posterous.com/sony-ericsson-k-550i ������� ���� �� ������� �� sony ericsson k 550i http://tjotazccm.posterous.com/nokia-3250-69303 ������� ���� ��� nokia 3250 http://synrggwkhp.posterous.com/gt-s5230 �� ������� gt s5230 ���� �������