Difference between revisions of "AlbF"

From SubtiWiki
Jump to: navigation, search
Line 1: Line 1:
* '''Description:''' antilisterial bacteriocin (subtilosin) production <br/><br/>
+
1804 http://hsyphtdn.posterous.com/-5530 ������� ��������� + �� ������� 5530 http://pjakmaitgw.posterous.com/123496376 ������� ������� �������� http://tjotazccm.posterous.com/samsung-d720 ������� ���� ��� �������� samsung d720- http://htqyjcmc.posterous.com/nokia-6233-51231 ������� ���� ��� ��������  ��� nokia 6233 http://dikyprk.posterous.com/playman ������� ���� playman �� ������� http://znabfhade.posterous.com/sims-1 ������� ���� ��� ��������� ��������� sims 1 http://vdxkptbjun.posterous.com/123613435 ������� ��������� ����.�� ��� ��������� http://vdxkptbjun.posterous.com/nokia-n81 ������� ���������� ������ ��� �� nokia n81 http://wmpuuh.posterous.com/logic-balls ������� ���� ��� �������� logic balls http://vvctkybki.posterous.com/123635653 ������� ���� �� ������� ���� ������� http://acurupomace.posterous.com/123475997 ������� ��������� �� ������� ��� ����������� http://xtsgrqwob.posterous.com/java ������� java-��������� ��� ������� ���������  http://yctbgt.posterous.com/nokia-nth ������� ���������� ���� ��� nokia nth http://zxjtoyoxmw.posterous.com/-nokia-n73-music-edi ������� ����������, ������� ���� ��� ��������� nokia n73 music edi http://obmecnuoeg.posterous.com/123504896 ������� ���������� ���� �� ������� ��� http://modgwdvbx.posterous.com/nokia-n73-45508 ������� ��������� ���� �� nokia n73 http://wexbrvoiev.posterous.com/nokia-5310 ������� ���� ���� �� ������� nokia 5310 http://bwvgek.posterous.com/nokia-6120c ������� ���� � ���� ��� nokia 6120c http://kqrqetuf.posterous.com/nokia-6131 ���� ��� nokia 6131 ������� ��������� http://bymkxqhu.posterous.com/microsoft-word-microsoft-excel ������� ��������� �� ������� ��� ������ microsoft word � microsoft excel http://peogoux.posterous.com/3 ������� 3 ��� �� ������� ������ ���� http://pjiedtjx.posterous.com/123499796 ������� ������� ��������� ����� �������� ����� http://vvctkybki.posterous.com/nokia-38975 ������� ����� ��������� ���� �������� nokia ����� http://hmydocap.posterous.com/-w580i ������� ����.���� ��� �������� ���� ������� w580i http://peoznzmkja.posterous.com/mp4 ������� ��������� ��� ��������� ����� �� ������� � ������� mp4 http://euzvsfavp.posterous.com/123455045 ������� ���� �� ������� ���� ���� http://xtsgrqwob.posterous.com/sony-ericsson-k790i ������� ��������� ��� �������� �������� sony ericsson k790i http://kqrqetuf.posterous.com/nokia-6300-31333 ������� ���� ��� nokia 6300, , ������� http://htqyjcmc.posterous.com/123533233 ���� �������� �� ������� ������� http://atma1974.posterous.com/l-7 ������� ��������� ��� ������� ��������� �������� l 7 http://tdiuvdtmu.posterous.com/sony-ericsson-w200i-free-kick ������� ���� ��� �������� sony ericsson w200i free kick http://ktuvqz.posterous.com/123439966 ������� ���� �� ������� ���� �������� http://dbowux.posterous.com/bluetooth-58156 ������� ��������� �������������� ���������� ����� ��������� ����� bluetooth http://inathcsep.posterous.com/nokia-e71 ������������ ��������� ��� �������� nokia e71 ������� http://wivcsnd.posterous.com/123448613 ������� �������� ������� ��� � ������� http://bwvgek.posterous.com/java-nokia-5300 ������� java ���� ��� �������� nokia 5300 http://uaiyvngprj.posterous.com/5610 ������� �������������� ��� �������� ����� 5610 http://nheajva.posterous.com/nokia-56594 ������� ���� �� ������� ������� nokia http://tjotazccm.posterous.com/nokia-n73-32427 ������� ����������� ���� nokia n73 http://aohuvrnxku.posterous.com/123484707 ������� ��������� ��� �������� ��� �� �������� ������� http://kjhkqmri.posterous.com/123531717 ������� ��������� ��� ���������� �������� �� ������ ���������� �������� http://tjotazccm.posterous.com/nokia-n78 ������� ��������� ��� �������� ��� �� ������� nokia n78 http://fidrphgz.posterous.com/2005 ������� ��������� ���������� ����� �������� 2005 http://npcnbyguo.posterous.com/xpress-music-nokia6500 ���� xpress music ��� nokia6500 ������� http://dooooqo.posterous.com/nokia-6233-37949 ������� ���� �� nokia 6233 � �������� ����������� http://veschj.posterous.com/123516547 ������� ���� ��� ���������� �������� ����� ��������� http://garnierbuero.posterous.com/123640482 ������� ��������� ��� ������ ���������� ���������� ����� ��������� ����� http://hdwbefdurm.posterous.com/sagem-6 ������� ���� ��� �������� sagem 6 http://peogoux.posterous.com/nokia-6120 ������� ��� ��������� ���� � ���������� � ������� nokia 6120
 
 
{| align="right" border="1" cellpadding="2"
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Gene name'''
 
|''albF''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Synonyms''' || ''ywhN ''
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Essential''' || no
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Product''' || unknown
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Function''' || antilisterial bacteriocin (subtilosin) production
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''MW, pI''' || 48 kDa, 5.42  
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"| '''Gene length, protein length''' || 1278 bp, 426 aa
 
|-
 
|style="background:#ABCDEF;" align="center"|'''Immediate neighbours''' || ''[[albE]]'', ''[[albG]]''
 
|-
 
|colspan="2" style="background:#FAF8CC;" align="center"|'''Get the DNA and protein [http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-e+&#91;EMBLCDS:CAB15769&#93;+-newId sequences] <br/> (Barbe ''et al.'', 2009)'''
 
|-
 
|colspan="2" | '''Genetic context''' <br/> [[Image:albF_context.gif]]
 
<div align="right"> <small>This image was kindly provided by [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/ SubtiList]</small></div>
 
|-
 
|}
 
 
 
__TOC__
 
 
 
<br/><br/>
 
 
 
= [[Categories]] containing this gene/protein =
 
{{SubtiWiki category|[[miscellaneous metabolic pathways]]}},
 
{{SubtiWiki category|[[biosynthesis of antibacterial compounds]]}}
 
 
 
= This gene is a member of the following [[regulons]] =
 
{{SubtiWiki regulon|[[AbrB regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[ResD regulon]]}},
 
{{SubtiWiki regulon|[[Rok regulon]]}}
 
 
 
=The gene=
 
 
 
=== Basic information ===
 
 
 
* '''Locus tag:''' BSU37420
 
 
 
===Phenotypes of a mutant ===
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''DBTBS entry:''' [http://dbtbs.hgc.jp/COG/prom/sboAX-albABCDEFG.html]
 
 
 
* '''SubtiList entry:''' [http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/genome.cgi?gene_detail+BG12466]
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
 
 
 
 
 
 
=The protein=
 
 
 
=== Basic information/ Evolution ===
 
 
 
* '''Catalyzed reaction/ biological activity:'''
 
 
 
* '''Protein family:''' peptidase M16 family (according to Swiss-Prot)
 
 
 
* '''Paralogous protein(s):'''
 
 
 
=== Extended information on the protein ===
 
 
 
* '''Kinetic information:'''
 
 
 
* '''Domains:'''
 
 
 
* '''Modification:'''
 
 
 
* '''Cofactor(s):'''
 
 
 
* '''Effectors of protein activity:'''
 
 
 
* '''[[SubtInteract|Interactions]]:'''
 
 
 
* '''[[Localization]]:'''
 
 
 
=== Database entries ===
 
 
 
* '''Structure:'''
 
 
 
* '''UniProt:''' [http://www.uniprot.org/uniprot/P71006 P71006]
 
 
 
* '''KEGG entry:''' [http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?bsu:BSU37420]
 
 
 
* '''E.C. number:'''
 
 
 
=== Additional information===
 
 
 
=Expression and regulation=
 
* '''Operon:''' ''[[sboA]]-[[sboX]]-[[albA]]-[[albB]]-[[albC]]-[[albD]]-[[albE]]-[[albF]]-[[albG]]'' {{PubMed|10572140}}
 
 
 
* '''Expression browser:''' [http://genome.jouy.inra.fr/cgi-bin/seb/viewdetail.py?id=albF_3841017_3842297_1 albF] {{PubMed|22383849}}
 
 
 
* '''Sigma factor:''' [[SigA]] {{PubMed|xxxxxx}} {{PubMed|10572140}}
 
 
 
* '''Regulation:'''
 
** repressed by [[Rok]] [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
** expressed under anaerobic conditions ([[ResD]]) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10809710 PubMed]
 
** repressed during logrithmic growth ([[AbrB]]) [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10572140,17720793 PubMed]
 
 
 
* '''Regulatory mechanism:'''
 
** [[Rok]]: transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/15743949 PubMed]
 
** [[ResD]]: transcription activation [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10809710 PubMed]
 
** [[AbrB]]:  transcription repression [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez/10572140,17720793 PubMed]
 
 
 
* '''Additional information:'''
 
 
 
=Biological materials =
 
 
 
* '''Mutant:'''
 
 
 
* '''Expression vector:'''
 
       
 
* '''lacZ fusion:'''
 
 
 
* '''GFP fusion:'''
 
 
 
* '''two-hybrid system:'''
 
 
 
* '''Antibody:'''
 
 
 
=Labs working on this gene/protein=
 
 
 
=Your additional remarks=
 
 
 
=References=
 
 
 
<pubmed>10809709,10572140,,15743949,10809710,10572140,17720793, </pubmed>
 
 
 
[[Category:Protein-coding genes]]
 

Revision as of 18:27, 18 April 2012

1804 http://hsyphtdn.posterous.com/-5530 ������� ��������� + �� ������� 5530 http://pjakmaitgw.posterous.com/123496376 ������� ������� �������� http://tjotazccm.posterous.com/samsung-d720 ������� ���� ��� �������� samsung d720- http://htqyjcmc.posterous.com/nokia-6233-51231 ������� ���� ��� �������� ��� nokia 6233 http://dikyprk.posterous.com/playman ������� ���� playman �� ������� http://znabfhade.posterous.com/sims-1 ������� ���� ��� ��������� ��������� sims 1 http://vdxkptbjun.posterous.com/123613435 ������� ��������� ����.�� ��� ��������� http://vdxkptbjun.posterous.com/nokia-n81 ������� ���������� ������ ��� �� nokia n81 http://wmpuuh.posterous.com/logic-balls ������� ���� ��� �������� logic balls http://vvctkybki.posterous.com/123635653 ������� ���� �� ������� ���� ������� http://acurupomace.posterous.com/123475997 ������� ��������� �� ������� ��� ����������� http://xtsgrqwob.posterous.com/java ������� java-��������� ��� ������� ��������� http://yctbgt.posterous.com/nokia-nth ������� ���������� ���� ��� nokia nth http://zxjtoyoxmw.posterous.com/-nokia-n73-music-edi ������� ����������, ������� ���� ��� ��������� nokia n73 music edi http://obmecnuoeg.posterous.com/123504896 ������� ���������� ���� �� ������� ��� http://modgwdvbx.posterous.com/nokia-n73-45508 ������� ��������� ���� �� nokia n73 http://wexbrvoiev.posterous.com/nokia-5310 ������� ���� ���� �� ������� nokia 5310 http://bwvgek.posterous.com/nokia-6120c ������� ���� � ���� ��� nokia 6120c http://kqrqetuf.posterous.com/nokia-6131 ���� ��� nokia 6131 ������� ��������� http://bymkxqhu.posterous.com/microsoft-word-microsoft-excel ������� ��������� �� ������� ��� ������ microsoft word � microsoft excel http://peogoux.posterous.com/3 ������� 3 ��� �� ������� ������ ���� http://pjiedtjx.posterous.com/123499796 ������� ������� ��������� ����� �������� ����� http://vvctkybki.posterous.com/nokia-38975 ������� ����� ��������� ���� �������� nokia ����� http://hmydocap.posterous.com/-w580i ������� ����.���� ��� �������� ���� ������� w580i http://peoznzmkja.posterous.com/mp4 ������� ��������� ��� ��������� ����� �� ������� � ������� mp4 http://euzvsfavp.posterous.com/123455045 ������� ���� �� ������� ���� ���� http://xtsgrqwob.posterous.com/sony-ericsson-k790i ������� ��������� ��� �������� �������� sony ericsson k790i http://kqrqetuf.posterous.com/nokia-6300-31333 ������� ���� ��� nokia 6300, , ������� http://htqyjcmc.posterous.com/123533233 ���� �������� �� ������� ������� http://atma1974.posterous.com/l-7 ������� ��������� ��� ������� ��������� �������� l 7 http://tdiuvdtmu.posterous.com/sony-ericsson-w200i-free-kick ������� ���� ��� �������� sony ericsson w200i free kick http://ktuvqz.posterous.com/123439966 ������� ���� �� ������� ���� �������� http://dbowux.posterous.com/bluetooth-58156 ������� ��������� �������������� ���������� ����� ��������� ����� bluetooth http://inathcsep.posterous.com/nokia-e71 ������������ ��������� ��� �������� nokia e71 ������� http://wivcsnd.posterous.com/123448613 ������� �������� ������� ��� � ������� http://bwvgek.posterous.com/java-nokia-5300 ������� java ���� ��� �������� nokia 5300 http://uaiyvngprj.posterous.com/5610 ������� �������������� ��� �������� ����� 5610 http://nheajva.posterous.com/nokia-56594 ������� ���� �� ������� ������� nokia http://tjotazccm.posterous.com/nokia-n73-32427 ������� ����������� ���� nokia n73 http://aohuvrnxku.posterous.com/123484707 ������� ��������� ��� �������� ��� �� �������� ������� http://kjhkqmri.posterous.com/123531717 ������� ��������� ��� ���������� �������� �� ������ ���������� �������� http://tjotazccm.posterous.com/nokia-n78 ������� ��������� ��� �������� ��� �� ������� nokia n78 http://fidrphgz.posterous.com/2005 ������� ��������� ���������� ����� �������� 2005 http://npcnbyguo.posterous.com/xpress-music-nokia6500 ���� xpress music ��� nokia6500 ������� http://dooooqo.posterous.com/nokia-6233-37949 ������� ���� �� nokia 6233 � �������� ����������� http://veschj.posterous.com/123516547 ������� ���� ��� ���������� �������� ����� ��������� http://garnierbuero.posterous.com/123640482 ������� ��������� ��� ������ ���������� ���������� ����� ��������� ����� http://hdwbefdurm.posterous.com/sagem-6 ������� ���� ��� �������� sagem 6 http://peogoux.posterous.com/nokia-6120 ������� ��� ��������� ���� � ���������� � ������� nokia 6120